建议恢复政治委员制度
1937年11月，时任八路军第一一五师第三四四旅政委的黄克诚（右）
在此期间，黄克诚被任命为八路军总政治部组织部长。他的直接领导是政治部主任任弼时、副主任邓小平。自从取消了政治委员制度，敏锐的洞察力让黄克诚始终感到不安和忧虑。适逢平型关战斗结束，黄克诚到一一五师检查政治工作情况。到达部队后，黄克诚进行了一次深入细致的调查，一些严重问题非常清晰地显现出来：部队取消了政治委员制度，从旅到连，各级只有正副军事领导人，多增一个副职。仅仅几个月的时间，部队作风就发生了很大的变化：政治工作明显被削弱了，军阀习气如同瘟疫在滋长蔓延，一些基层干部甚至模仿起了国民党军官的作风，大讲排场。原有的红军传统、党的核心领导作用被严重削弱，队伍中潜伏着一种致命的危机。如此下去，部队难免要面临改变性质的危险。
在洞察到这种危害后，黄克诚对师首长说了自己的想法，“建议恢复我军政治委员制度，开展反军阀斗争，保持我军的光荣传统。”在师首长表示赞同后，黄克诚立即将意见汇报给任弼时。在任弼时的支持下，黄克诚没多久便完成了一份题为《目前军事建设中的部队政治工作》的报告。黄克诚在报告中认为：“历史教育我们，我党要保持对军队的绝对领导，非依靠政治委员不可；特别是在今天民族敌人与其他方面危害分子严重威胁破坏根据地，与军队分散隔绝，上级领导不易集中等情况下，就更显得尤为重要了。”“政治工作的建设是目前军事建设的重要组成部分。离开了政治工作建设，则军事建设是不完备的，甚至军事建设本身将受到严重的损失。”这份报告随即以朱德、彭德怀、任弼时三个人的名义上报给党中央。
毛泽东接到报告后，曾一连几天，窑洞里的灯光彻夜不熄。很显然，毛泽东也意识到了这个问题的严重性。不久，中共中央军委便宣布恢复了八路军的政治委员制度。从那时起至今，中国共产党所领导的军队虽然几经易名，却再未更改过部队中军政各有一个主官主持工作的制度。
在恢复政治委员制度的同时，党中央又乘势在全军展开了整顿军阀残余作风的运动，一批卓越的政治领导人聂荣臻、关向应、邓小平等走上了领导岗位，为这支军队的成长鞠躬尽瘁。黄克诚本人也被任命为一一五师三四四旅政治委员。
黄克诚无疑成为这一时期中国军队在历史转折关头时的焦点人物，他坚持实事求是原则，及时发现了部队的军阀习气并予以纠正，并建议恢复政治委员制度。他敏锐的政治洞察力、高度的责任心，促使他站在全局角度上秉义直言。
建议开展反摩擦斗争
1940年9月底，为支援新四军进行黄桥战役，黄克诚率八路军第五纵队南下盐城。
这是黄克诚在干部会上作动员讲话
黄克诚继1937年建议恢复八路军的政治委员制度后，又于1940年初向中央提出了第二个建议—开展反摩擦斗争。由于这项建议及时、准确，使得八路军的拓展方略得以实施，部队硕果予以巩固。
1939年，正当八路军革命力量日益发展壮大之时，国民党顽固派的反共活动也日益频繁，反共顽军不断地向抗日根据地军民寻衅滋事，肆意妄为，制造摩擦，妄图削弱八路军实力，进而彻底消灭八路军。特别是在1939年底和1940年初，反共摩擦活动达到了高峰，国民党背信弃义、肆无忌惮：在西北，胡宗南部向陕甘宁边区进犯，占领县城，并觊觎延安；在山西，阎锡山向抗日新军和八路军进攻，杀害抗日军民，企图摧毁抗日民主政权；随后，蒋介石又调集10万军队大举进犯太行、太岳、冀南、冀鲁豫抗日根据地。这其中以国民党顽军石友三、朱怀冰等反共活动最为突出，甚至妄图袭击八路军总部。
山雨欲来风满楼。面临严峻的形势，黄克诚忧心忡忡，相机待变。适逢彭德怀从延安经西安、洛阳进入晋东南地区，快到平顺时，黄克诚连忙赶去迎接。一见面，就直接向他汇报了国民党军队与八路军摩擦的情况，一路上两个人边走边谈，分析局势，谈应敌策略。一到旅部，彭德怀的作战方案便成竹在胸，立即下令调动部队准备打朱怀冰。彭德怀打仗历来都是坚决果断，但这次是要打与红军有统战关系的国民党军队，而且又难免是一个大仗。黄克诚思前想后向彭德怀建议先请示延安再动手，因担心延误战机，彭德怀一面派人发电报调动部队，一面报告延安。
在彭德怀和一二九师首长的指挥下，反摩擦战役很快就打起来了。石友三部首先被打垮，紧接着是朱怀冰、鹿钟麟、张荫梧等部陆续被打垮。至此，八路军彻底打退了国民党掀起的第一次反共高潮，巩固了太行革命根据地。值得一提的是鹿钟麟在林县被黄克诚部三四四旅活捉，黄克诚得知后随即将他放回，从而也确保了统战关系的连续性。
一个战略家的基本素质就是看问题时要有较高的起点，能勇敢地超越自我，站在党的立场上直抒己见，屡献良策，并能站在民族大业的高度审时度势。黄克诚无疑就是这样的人，他坚持真理，在共产党和国家面临危机的历史关头，敢于直言献策，为党和军队避免了不必要的损失。
建议进军华中
1941年，时任新四军第三师师长的黄克诚
黄克诚在抗战中的第三次谏言—进军华中，更是具有历史意义。这一谏言被采纳后，不仅打通了八路军和新四军的联系，也使华中的抗日根据地连成一片，极大地加速了抗日救国战争的进程。
1940年4月，黄克诚奉命离开太行山赴冀鲁豫，率领三四四旅和纵队直属队越过平汉路，到冀鲁豫与新二旅、新三旅会合。到达冀鲁豫和杨得志会合后，奉命组建了冀鲁豫军区和军政委员会，黄克诚兼任军区司令员及军政委员会书记。此时部队已发展到2万余人，黄克诚考虑到冀鲁豫集中这么多部队，不利于大部队的活动和发展，回旋余地也不大，遂根据中央“巩固华北，发展华中”的战略部署精神，向中央和总部建议将部队分成两部分，由黄克诚和杨得志各带领一部分，一面坚持冀鲁豫斗争，一面越过陇海路，向华中发展。
黄克诚的建议，得到了中央军委的高度重视，在主要领导人达成共识后，中共中央于4月17日电示：新二旅及三四四旅共12000多人，由太行山出发，在冀鲁豫边界设法消灭石友三部后，随时准备调往陇海路南，配合彭雪枫部行动。5月，黄克诚率部挺进华中。6月20日，南下的先头部队到达豫皖苏边区新兴集，与彭雪枫率领的新四军六支队会合。6月27日，中央军委电示与彭雪枫部合编为八路军第四纵队。彭雪枫任司令员，黄克诚任政委。
随后，根据中央的战略意图，黄克诚将三四四旅（欠六八七团）留在彭雪枫部，自己则率领新二旅的第五、第六团和三四四旅的第六八七团及部分兵力，离开豫皖苏，越过津浦铁路，向皖东北挺进，开辟、建设了苏北敌后抗日根据地，创建了拥有4万多平方公里土地和800多万人口的苏北解放区。此时已改编为新四军三师的原八路军一一五师三四四旅，也由开始组建时的2万余人发展到7万余人，后成为东北战场上的攻坚主力部队。
黄克诚一生胸襟坦荡，因敢说真话为众人所敬佩。当然，在任何一个历史时期，讲真话都伴随着风险性，这也就不难解释黄克诚的一生为何多次陷入低谷。但他依旧坚持原则，审时度势，放眼全局，将民族大业置于首位，时刻从党的立场出发，虽经磨难而不改初衷，前人尚且如此，后人更当为之。
（胡厚良：解放军65521部队军史馆馆长 周田坤：解放军65521部队军史馆干部）